AICE-IZEA se rige por sus respectivos Estatutos, que regulan entre otros aspectos sus órganos de gobierno. Estos son la Asamblea General de socios y la Junta Directiva.

La primera se reúne al menos una vez al año, siendo el órgano soberano como representante de la voluntad de todos sus miembros.

La Junta Directiva, compuesta por 10 miembros, tiene como Presidente a D. Luis Bergaretxe Arruti y como Vicepresidente a D. Borja Martínez de Bedoya.